As inscrições vão para o espaço Schengen, não para os países, por isso, para a sua viagem à Alemanha, Paris e Itália, você só teve uma entrada.
Como ninguém (em Schengen) se importa se você vai para casa ou para outro lugar que você está autorizado a ser, várias viagens (para Schengen, se você considera que viagens múltiplas não dizem respeito aos países Schengen) é praticamente o única coisa que você pode usar um visto de entrada múltipla para (dentro das outras regras - período de validade e 90/180 - é claro).