Como não é explicado no episódio, acho que podemos extrapolar do espaço as equivalências reais da vida das abelhas e vespas - existem espécies de vespas que atacam as abelhas, chamadas beewolves .
Nós mostramos os restos da tripulação anterior da Planet Express ainda na colméia, então obviamente seus corpos não foram completamente consumidos, mas presumivelmente quando os corpos apodreceram, os chips se soltaram. Eles poderiam então ter aderido a uma abelha dado todo o espaço ao redor.
Aquela abelha, ao deixar a colméia para coletar pólen espacial, foi atacada e consumida pela vespa espacial, incluindo os chips que estavam presos a ela. Quando a vespa espacial é morta, os chips foram encontrados em seu estômago e enviados para o professor rotulado como tal.
Quanto aos chips enviados ao Professor, não há muita informação sobre o que está contido nos chips de carreira. Podemos presumir que o empregador não faz parte disso, já que vemos Fry ter seu inserido como "entregador" antes mesmo de Fry conseguir um emprego. Se supusermos que os nomes dos implantados fazem parte da informação, isso se torna bastante simples - um pouco de pesquisa sobre nomes pode render ao seu empregador e, a partir daí, é apenas uma questão de entrega.
Se essa suposição não for feita quanto ao conteúdo das fichas, a explicação mais provável é que quem "obteve" o conteúdo do estômago da vespa espacial estava ciente do navio da Planet Express que entrou na colméia e razoavelmente assumiu que os chips pertenciam eles. Isso poderia ter sido alguém na localidade da colmeia na época ou alguém que o professor contratou para recuperar as fichas.
De qualquer forma, isso é tudo suposição, pois não acredito que uma resposta canônica tenha sido fornecida.