Não
A descrição do Polymorph inclui as seguintes seções:
Target: Willing living creature touched
Incorporeal or gaseous creatures are immune to being polymorphed...
A descrição de uma sombra em 3.5e (MM p221) classifica como:
Medium undead (incorporeal)
A mágica Polymorph simplesmente não pode mirar a Shadow invocada do Shadowdancer, porque ela não é um alvo válido.
Este princípio é estendido a todos os feitiços do tipo Polimorfo na discussão destes na página 96 do PHB II:
Incorporeal or gaseous creatures are immune to polymorph spells, as are creatures of the plant type.
Eu sugiro que polimorfizar uma sombra seria uma estratégia abaixo do ideal, mesmo se o seu GM governasse uma exceção. Se você quer algo que se pareça com um clone de você sob seu controle, então há maneiras muito mais fáceis - o feitiço Parecer pode ser lançado em sua Sombra, ou polimorfo, um companheiro animal ou mercenário.
Esta resposta endereça 3.5e em vez de Pathfinder com base no texto do título da pergunta.