O centro histórico da cidade é Saint Jean. Outras partes ainda consideradas o centro são Bellecour, a Croix Rousse, a Part Dieu.
Villeurbanne está muito perto também. Eu fui para a faculdade lá e é seguro. Para caminhar até a cidade histórica de lá levar 40mn ou mais. Embora haja um limite de cidade e um sinal entre os dois, você não pode "ver". As ruas continuam entre os dois, como acontece entre Washington, DC e Bethesda, por exemplo.
Aqui está um mapa dos principais sites. Se você ficar dentro de um dos principais "arrondissements", ou seja, bairros (numerados de 1 a 9 - eu escolheria 1, 2, 6, 4, 5, 9), é bom ir.
Lyon também tem um ótimo sistema de transporte (ônibus, bonde e metrô) para que você possa facilmente pegar um hotel na linha de transporte e estar na cidade em poucos minutos.
Lyon também tem dois rios - o Saone e o Rhone. Ficar perto desses rios aumenta o charme.
Talvez o melhor seja encontrar um airbnb no antigo centro da cidade (Saint Jean). Mas se você se preocupa mais com o conforto, pode experimentar qualquer um dos hotéis Accor (a Accor é uma grande rede francesa como Hilton ou Marriott nos EUA, com hotéis que variam de muito simples a luxuosos).