Dado o texto das Lesões Prolongadas ao se referir à cura, ela especifica que a cura restaura a Lesão Prolongada (Lingering Injury). Como tal, eu diria que a cura só restaura os ferimentos sofridos com o uso do mecanismo das Lesões Prolongadas.
Mas por outro lado, o livro apenas diz que a cura mágica é tudo o que se pretende que seja. Qualquer coisa além disso depende do Mestre.
Se você quiser manter uma cicatriz do que sim, fale com o Mestre.