Eu não estou ciente da explicação direta do cânone. Alguns possíveis (o último é mais canônico que o resto):
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A sala pode invocar objetos de qualquer lugar. Trouxe, como sua citação mostrou, livros sobre DaDA e vários instrumentos do comércio.
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Esta é a teoria de Harry de que era a mesma. Não precisa estar correto
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Mesmo se estiver correto, não temos evidência de que o Glass tenha pertencido a Moody ou Crouch. Se Crouch, teria ficado em Hogwarts, pois não havia nenhum membro da família vivo para reivindicar seus pertences. Se Moody's, pode ser possível que tenha sido deixado para trás - ou porque Moody ainda estava se recuperando e não se incomodou, ou porque ele não precisava e estava quebrado.
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ATUALIZADO Harry roubou do escritório da falsa-Moody, ao mesmo tempo em que ele fez o mapa do Maroto:
HPFreak7: How did Harry get the Marauder's Map back, when Crouch Jr. had it last?
JK Rowling replies -> Loads of people have asked me this, I knew I should have shown Harry nipping into Moody's empty office and getting it back, but I assumed you'd all know that's what he did. Sorry! (JK Rowling's World Book Day Chat, March 4, 2004)