Não leia muito no "mar"; não há regra de que toda palavra na língua deva se ater exatamente às suas raízes etimológicas.
Marisco significa apenas vida aquática comestível, ou seja, peixe e marisco em geral. É uma palavra de comida, não uma palavra de biologia, e pescar no seu prato parece praticamente o mesmo, seja peixe de água doce ou salgada, então geralmente tudo é agrupado em uma categoria.