Os Jedi no templo estavam em grande desvantagem. Os Jedi mais capazes eram os combates fora do mundo que lideravam o Exército Clone e aqueles que foram deixados em Coruscant eram os jovens, os idosos, alguns guardas, vários funcionários do Templo (bibliotecários, mecnicanos, cortadores e tal) e alguns membros do Conselho que não eram. no prédio quando o ataque aconteceu.
Quando a Ordem 66 foi decretada, os Jedi foram sistematicamente mortos pela galáxia ao longo de apenas alguns minutos. Aqueles que permaneceram vivos parecem estar sofrendo de algum tipo de choque relacionado à Força na mudança no equilíbrio da Força da luz para a escuridão. Além disso, os Clones não são realmente malévolos, apenas seguindo suas ordens de forma desapaixonada:
With the Jedi Order overextended, spread thin across the galaxy, each Jedi is alone, surrounded only by whatever clone troops he, she, or it commands. War itself pours darkness into the Force, deepening the cloud that limits Jedi perception. And the clones have no malice, no hatred, not the slightest ill intent that might give warning. They are only following orders.