A coisa que você está chamando de pessoal de Loki - o objeto que abrigou a Pedra da Mente - não é algo que Loki teve por décadas. Na verdade, foi dado a ele por Thanos, como parte de seu plano para que os Chitauri invadissem a Terra. Ele só teve isso por um curto período de tempo, antes de perdê-lo para a SHIELD.
Mesmo enquanto Loki tinha o cetro, ele não estava controlando a Pedra da Mente diretamente; ele estava usando uma ferramenta construída especificamente para aproveitar seu poder de maneiras específicas (muito parecido com o Tesseract ou o Aether). O poder bruto da Pedra provavelmente teria dominado até ele.
Então, não há realmente nenhuma razão para acreditar que o Loki possa controlar o Vision. (Pelo menos, não por causa do cetro).