Trouxas tinham medo e superavam em número os magos, e Hogwarts não tinha treinamento.
Como sua própria citação diz, Hogwarts foi fundada quando o medo da magia era comum.
They built this castle together, far from prying Muggle eyes, for it was an age when magic was feared by common people, and witches and wizards suffered much persecution." - Harry Potter and the Chamber of Secrets, Chapter 9 (The Writing on the Wall)
Os Fundadores tiveram que esconder Hogwarts porque muitos trouxas temiam magia. Trouxas superavam em número os magos, então se os trouxas decidissem destruir Hogwarts, eles provavelmente teriam sucesso direto ou então causariam muito dano, mesmo se os magos fossem mais habilidosos em geral. Multidões e táticas de guerrilha podem derrotar até mesmo os oponentes mais habilidosos, especialmente se seus números forem pequenos. Sabemos que há muito mais trouxas do que magos, então os trouxas ganhariam ou dizimariam a população bruxa em uma guerra trouxa / bruxo.
Além disso, enquanto o corpo docente poderia ter uma melhor chance de se defender, a maioria dos bruxos de Hogwarts seria ensinada a usar magia, então eles seriam relativamente indefesos. Hogwarts seria um alvo fácil para os trouxas tentando diminuir o número de magos. Se os trouxas soubessem de um lugar onde estavam treinando jovens magos para fazer magia, é claro que seria um alvo óbvio. Não só é em algum lugar que apenas os magos se reuniriam, mas a maioria deles seria alunos destreinados e, portanto, mais fáceis de matar.