Você não enviou o seu DS-160 para o consulado. Fundamentalmente, você o envia para o consulado quando você aparece lá para a sua entrevista (tecnicamente agora você geralmente envia uma página de referência, mas eles não a consideram como sendo submetida até aquele momento).
Portanto, não, você não terá problemas com o que fez e não há necessidade de excluir o aplicativo original de Londres. O DS-160 original que você preencheu nunca será colocado em prática e provavelmente será excluído silenciosamente.