Sim, você poderá transitar em Frankfurt e Munique na Lufthansa com um ATV se todos os seus voos estiverem reservados no mesmo bilhete. Nesse caso, você receberá seus cartões de embarque para cada etapa do seu voo no ponto de partida (Deli em sua viagem de ida e Cidade do México em sua viagem de ida). Suas malas também serão verificadas até o destino final. Em nenhum momento durante o seu trânsito você entrará na Zona Schengen. Se, por qualquer motivo, você não receber cartões de embarque para toda a viagem nos dois pontos de partida, poderá coletá-los no aeroporto de trânsito no balcão de atendimento ao cliente da Lufthansa.
Fonte: Sou um passageiro frequente da Lufthansa em trânsito pela FRA e pela MUC com frequência.