Eu acredito que não temos nenhuma instância do borg interagindo com os fundadores. Principalmente porque os changelings habitam principalmente o quadrante gama, enquanto os borgs estão primariamente no quadrante delta.
Como não temos encontros conhecidos, agora precisamos especular. Os changelings são uma das formas de vida mais avançadas que interagem com a federação (sim, existem muitas formas de vida avançadas no startrek, no entanto, são jogadores ativos). Suas habilidades os tornam altamente resistentes a danos físicos, além de serem capazes de mudar de forma quase perfeitamente.
Outra raça que encontramos Espécie 8472 possui habilidades muito semelhantes às dos changelings em que seus corpos são altamente resiliente, bem como ser capaz de mudar de forma quase perfeitamente. Esta é a única espécie conhecida que sabemos que o borg não pode assimilar.
Portanto, com base nas semelhanças entre os changelings e a espécie 8472, eu arriscaria que os changelings seriam extremamente difíceis, se não impossíveis de assimilar. O fato de que a forma primária dos changelings é um líquido, parece que eles poderiam simplesmente liquefazer e encolher todos os nanites.Como uma nota lateral, a Espécie 8472 é do espaço fluídico, e os changelings são primariamente um fluido, e ambos se transformam em hrmmm lol.