Brownies com várias camadas são certamente possíveis, mas se você tentar torná-lo muito grosso, pode ficar muito denso na parte inferior, porque o peso não permite nenhum tipo de aumento (a maioria dos brownies cresce, mas não muito, mas é ainda importante). Eu faço um brownie de chocolate triplo com uma camada de caramelo salgado no meio e ele sai muito bem, é uma receita única dividida em duas partes.
Sua idéia é fazer duas caixas e então fazer 4 camadas, pode funcionar muito bem, se fosse eu eu faria isso em dois lotes e depois colocaria as duas camadas superiores depois que elas esfriassem.
Quanto ao que colocar entre você vai querer escolher ingredientes que são marcadamente diferentes do próprio brownie. Caramelo contrasta como o chocolate branco, mas uma camada de chocolate no brownie de chocolate é menos provável de ser notada.
Quanto à quantidade de óleos e ovos, siga a receita ao pé da letra, não mexa com ela, pois a consistência já está otimizada. Se você quiser experimentar, faça isso em pequenos lotes para poder medir os resultados antes de se comprometer com um grande aumento.