A American Airlines irá NÃO verificar através de sacolas em um bilhete separado. Isso significa que, em Sydney, você precisaria liberar a imigração, pegar suas malas, liberar a alfândega, verificar novamente e depois voltar pela imigração / segurança. Você também precisaria de um eTA ou visto para entrar na Austrália.
Oficialmente, o check-in da Qantas International fecha 90 minutos antes da partida do voo. Então, com bastante clareza, não, sua primeira opção não funcionará.
Se você puder comprar os dois vôos no mesmo PNR, poderá despachar as malas até Queenstown. Em Sydney, você simplesmente precisará redefinir a segurança e encontrar o portão de embarque. Nesse caso, 90 minutos serão mais do que suficientes (e, se não forem, devido a um voo atrasado, você será refazer a reserva devido a tudo no PNR / bilhete). A reserva como um bilhete único também economizará para pagar algumas das taxas de alfândega / imigração da Austrália, já que você será apenas um passageiro em trânsito.