Sem as curvas de desempenho, é impossível dizer, mas em geral, o equipamento é mais eficiente quando não está operando perto da carga máxima ou mínima, então sim, é possível que duas unidades, cada uma operando em 40-70% de sua capacidade nominal, poderia ser mais eficiente do que uma única unidade operando com > 90% de sua capacidade.
Este link é na verdade, sobre fontes de alimentação de computadores, mas ilustra quantas curvas de desempenho parecem. Realisticamente, isso deve servir para ilustrar o dimensionamento adequado, de modo que a operação normal esteja próxima da eficiência máxima, com desempenho máximo correspondendo à carga máxima prevista.