Sua melhor opção é entrar em contato diretamente com a ANA e perguntar a eles.
Se o bilhete já foi emitido, verifique o número do bilhete: se começar com 205, é o bilhete da ANA e provavelmente você está bem. Se começar com 691 é um bilhete da Jet Airways e você pode ter problemas aqui.
Estou a pensar: se é um bilhete da ANA, tem boas hipóteses de o manter. Um bilhete só é emitido após o pagamento, portanto, a conversão de "milhas para ingresso" aconteceu no momento da reserva e não depende de eventos futuros. Então a ANA já foi paga pela Jet Airways em qualquer método que nos compensar um ao outro.
Nesse sentido, as milhas são semelhantes a comprar com uma moeda estrangeira. A troca acontece no momento do pagamento, não no momento do vôo.