O vírus Extremis tem alguma coisa a ver com Tony…

Não está definitivamente resolvido, mas podemos fazer várias suposições:

• Se Stark tivesse sido capaz de remover os fragmentos antes, ele teria feito isso ao invés de arriscar a morte agravando seu potencial dano cardíaco várias vezes levando seu corpo ao limite.

• Foi-lhe dito que seria impossível remover os fragmentos, independentemente de quão habilidosos fossem os cirurgiões, nenhum deles estava disposto a arriscar.

• Como ele conseguiu fazer engenharia reversa da tecnologia e dos efeitos do Extremis da Pepper, ele teria tanto a tecnologia para criar o processo quanto para revertê-lo.

It would be logical for Stark to create a means of activating and utilizing the Extremis process in conjunction with an excellent surgical team because even if they made a mistake removing the shrapnel, a slight activation of the Extremis technology would repair any damage long enough for any surgeon to do their work. Why not utilize it to remove the shrapnel if he could?

Uma resposta alternativa também pode ser:

The giant electromagnet above the surgeon's heads may have been an invention created specifically by Stark to aid a previously unwilling surgeon to take the risk in removing the metallic shards.

Nos quadrinhos, Tony se infecta com um vírus fixo do Extremis. Isso permitiu que Tony se conectasse à sua rede sem um fone de ouvido ... ele deu a si mesmo melhores reflexos e alguns dos componentes do traje de ferro em seu corpo. O fato de eles terem mostrado Tony conversando com Jarvis sem um fone de ouvido me diz que ele modificou o vírus Extremis e se infectou, o que permitiu que ele se recuperasse desse tipo de cirurgia.

Algo que me pareceu estranho na época foi que, no final de Iron Man 3, Tony disse especificamente que ele 'consertou' a infecção por Pepper Potts Extremis, note que ele não disse curar nem removeu.

Isso me leva a pensar se ele realmente aperfeiçoou o vírus Extremis, inclinando-se assim para seu próprio uso do vírus em Iron Man 4 ou na próxima excursão dos Vingadores?

Tony narra: Os ternos eram um casulo. Eu sou um homem mudado. Eu sou o homem de Ferro. Espero que os Vingadores 2 mostrem seus trajes extremos.

Acho que não, ele estava apenas continuando com o seu

compromise to Pepper, exploding his armors and everything

Minha esposa apontou que ele foi capaz de fazê-lo porque ele ganha conhecimento de como usar

The extremis correctly, and some how he used extremis to heal.

Não acredite que foi um vírus nem foi o veículo para o medicamento um vírus. Eu pensei que ele usou a tecnologia do reator para desenvolver um procedimento cirúrgico para tornar a remoção do sharnel possível sem o mesmo nível de risco.

Completando todas as outras respostas, Tony diz: "As pessoas dizem que o progresso é perigoso; elas não precisam viver com um monte de estilhaços no peito". OMI, isto afirma que o "progresso" foi feito para o vírus Extremis. O que não está claro é como ele usou: ou apenas para remover o estilhaço ou injetado por um período indefinido de tempo.

Em Homem de Ferro 3, Tony tem a capacidade de controlar todas as peças e o traje em si com sua mente. Nos quadrinhos, isso é possível devido ao vírus Extremis com o qual ele está infectado. Então, no filme, talvez o cirurgião e a habilidade de controlar seu traje com sua mente também sejam possíveis porque ele já possui o Extremis dentro dele desde o começo do filme.