Leia por sua conta e risco; isso é cheio de spoilers.
Ele deve ter o Elder Wand.
Como você disse, Grindelwald parece ser de meia-idade quando Feras Fantásticas é definido. Grindelwald nasceu em 1883 ( wiki ) e Fantastic Beasts acontece em 1926, quando Grindelwald era nos seus 40 anos. Seu duelo com Dumbledore aconteceu em 1945. Aqui está uma citação do livro 7 sobre Grindelwald quando ele roubou a varinha de Gregorovitch:
and there on the window ledge sat perched, like a giant bird, a young man with golden hair. In the split second that the lantern's light illuminated him, Harry saw the delight on his handsome face...
Obviamente, ele roubou o Elder Wand antes dos eventos do filme. Então, no momento em que ele se faz passar por Graves, ele é o mestre do Elder Wand.
Mas ele tem o Elder Wand? Não . Esta resposta no movies.se mostra isso muito melhor do que eu poderia. Que varinha ele está usando? Provavelmente apenas a própria varinha de Graves.
Quanto à sua última pergunta sobre Newt, Newt agora é o mestre da Varinha dos Anciões. Quem sabe se isso foi de propósito, então pode ser um ponto de trama mais tarde, ou ... não. De qualquer forma, teremos que ficar atentos para as pessoas desarmar Newt em filmes posteriores.