Pelo que me lembro, o filme não mostrou nada de específico acontecendo com Reed para dar a ele o poder que ele conseguiu. Minha interpretação é que a mudança dele só aconteceu depois que ele voltou ao universo:
Ele estava preso debaixo de uma pilha de metal e escombros, mas ele estava desesperadamente tentando alcançar seu amigo para ver se ele estava bem. Desde que ele não podia libertar as pernas, seu corpo respondeu estendendo-se para deixá-lo se mover de qualquer maneira. Qualquer força que lhe desse seu poder, respondia ao que ele estava "pensando" na época.
Observe também que Sue não foi atingida por nada do Planeta Zero que também não atingiu Reed; ela foi pega no refluxo da explosão em si, assim como os outros três. É possível que seus pensamentos na época (talvez "eu não deveria estar aqui", seguido de "eu poderia usar um escudo de explosão agora") também influenciaram seu poder.
(Sim, entendi, é fino; teria sido muito melhor para eles deixar os quatro poderes como aleatórios, mas infelizmente eles não o fizeram.)