É assim que o sistema dos EUA opera. Você clareia imigração e alfândega no primeiro lugar de chegada. Você precisa de sua bagagem para passar pela alfândega, assim você deve verificar sua bagagem. Na minha experiência, sempre foi marcado para o seu destino final, reverificando envolve simplesmente soltando no balcão ou às vezes apenas um cinto. Eu nunca esperei mais de 30 segundos apenas quando houve um defeito no equipamento.
Os EUA não têm nenhum controle de fronteira de saída, ponto final. A única razão pela qual você tem que mostrar um passaporte para embarcar em um voo internacional é porque a companhia aérea não quer se meter em problemas por levar um passageiro inadmissível ao destino. No tempo antes da repressão de segurança que se seguiu ao 11 de setembro, você poderia ir até um portão de embarque internacional sem passaporte. Mesmo nestes dias eu tenho andado de um portão de embarque internacional para fora do aeroporto (não mostrando nada) e de volta (mostrando meu passaporte e cartão de embarque - mas ID e cartão de embarque estariam bem).
Por causa disso, não há como lidar com passageiros em trânsito. Você não pode impedi-los de sair do portão, assim você tem que admiti-los antes de deixá-los chegar ao portão.