O Wiki literalmente explica isso nos dois primeiros parágrafos.
Vou parafrasear:
Scar, o "bom predador" do filme anterior, carregava uma caixa que continha os genes Alien e Predator. Explode de Scar, amadurece rapidamente e mata muitos predadores. O último predador sobrevivente consegue levar um sinal de socorro ao seu planeta natal, onde um predador solitário decide levar a Terra para matar todos os alienígenas.
Não estava trancado, estava dentro de um dos corpos do Predator. Então ele começou a matar todos os Predators a bordo do navio.