O que parece é que você tem um piso de cerâmica.
Você precisa usar dois flanges - a razão para essa configuração é que o flange do tubo não fica alto o suficiente para que o vaso seja adequadamente encostado - a altura do ladrilho é um problema um pouco alto demais. Portanto, o procedimento comum é instalar um flange espaçador ou extensor. Normalmente você terá uma calafetagem para formar uma junta entre os dois flanges inferiores. Clink meu link abaixo para obter os detalhes.
Aqui estão as opções e um layout mais detalhado do que e por que e como resolver o problema.
Como remover uma junta de sanita de flange de metal e substitua-o - algumas ideias para reparo estão incluídas.