Embora eu não seja funcionário do departamento de desenvolvimento de produtos de empresas que fazem produtos com esse rótulo, tenho experiência empírica com um produto rotulado conforme você descreve.
Quando a gordura está presente em um microondas e em contato com o recipiente, a superfície do produto pode se deformar de uma maneira que retenha os alimentos e, portanto, represente um risco para a saúde. Isso pode acontecer com um molho que tenha apenas um pouco de gordura flutuando no topo. O gerente de produto deve garantir que você não compre este produto se tiver gordura em sua dieta e estiver procurando algo para usar ao reaquecer alimentos como parte de seu estilo de vida e, assim, eles o rotularam para protegê-lo de fazer uma compra incorreta. Eu justifico isso como o provável motivo com uma anedota:
I once reheated food in such a container with a sauce that had a little bit of fat floating on it (maybe a tablespoon's worth). The plastic deformed where the fat was floating and did so in a way that it was no longer safe to use because of the risk of bacterial growth.
Acho que é por isso que eles adicionam esse rótulo e é isso que pode acontecer.