Você pode escrever para o posto de emissão e pedir-lhes para revogar seu visto Schengen. Pode ser algo simples como ...
Due to a change in circumstances I will not be using my Schengen visa (Visa #XXXXX, Passport #YYYY). Accordingly, please revoke it. I will make a fresh application at a later date.
Não há preconceito associado a uma revogação voluntária; na verdade, eles gostam quando as pessoas fazem isso. Quando você se inscrever novamente, eles o verão no banco de dados e seus procedimentos a seguir serão contados a seu favor. Mas você também não pode fazer nada e deixar o visto expirar.
Qualquer opção é boa.