Como você reservou o seu ingresso através do site do IRCTC, ao acessar a página "Histórico dos ingressos reservados", há a opção "Alterar ponto de embarque", além de "Cancelar ticket", "Obter status do PNR" etc. Você pode usar a opção de mudança de ponto de embarque para fazer alterações no ponto de embarque desejado, que no seu caso é o Pune.