Não é explicado diretamente no filme, mas o diretor meio que explica isso em entrevistas antes do lançamento (em resposta aos trailers, principalmente.)
É sabido no mundo dos quadrinhos por um longo tempo que o metal adamantium no corpo de Wolverine está envenenando ele. A única razão pela qual ele pode sobreviver a esse processo é porque seu fator de cura está constantemente reparando o dano do metal. De fato, tem havido momentos nos quadrinhos quando Logan perde seu adamantium, e ele é notavelmente melhor - mais rápido, mais strong, mais curado, etc. A natureza exata desse envenenamento é algo inconsistente nos quadrinhos; em alguns lugares, o metal é chamado como explicitamente venenoso, mas em outros casos, é explicado como algo específico para o processo de ligação com o qual Logan passou).
Em qualquer caso, em Logan , o metal é aparentemente venenoso. Logan diz isso ao Dr. Rice no filme, e o Dr. Rice nem sequer tenta contradizê-lo:
Não está claro se Stryker e sua equipe sabiam disso quando o aplicaram pela primeira vez, mas Zander Rice está ao menos ciente de seus efeitos até 2029 (embora ele ainda tenha escolhido aplicá-lo a Lara).Logan: He's [Rice's father] the one that put this poison in me.
Normalmente, o fator de cura de Logan mantém esse problema sob controle. Mas como Logan envelhece, seu fator de cura está começando a enfraquecer. Ainda está trabalhando para mantê-lo a salvo do adamantium, mas isso impede que ele trabalhe efetivamente para curar suas outras feridas. Ele ainda cura, mas lentamente, e deixa cicatrizes. E se ele sofrer uma lesão traumática maior, ele pode não ser capaz de se curar disso.
Isso é o que o diretor havia sugerido antes do lançamento do filme, embora não especificamente:
JAMES MANGOLD: We imagined that it may have when he was younger, but with age, he’s getting older and ailing. Perhaps his healing factor no longer produces baby-soft skin.