Na minha mesa eu diria que você pode ter uma habilidade diferente (através do "se algo lhe dá proficiência em uma habilidade que você já tem, você pode escolher outra" regra citada), mas que a perícia só se aplica a uma dessas quatro habilidades listadas em Blessings of Knowledge (e você obteria pela habilidade que você já tinha), então isso não é uma maneira secreta de obter experiência em alguma habilidade aleatória. Que se sente mais próximo das regras como IMO pretendido.
Dito isso, não consegui encontrar nenhuma decisão autoritativa em nenhum lugar, e as várias pessoas na Internet que estavam falando sobre isso tinham várias decisões diferentes, portanto, eu esperaria uma variação na tabela.