Sim, existem algumas alterações, mas são pequenas e pequenas. Como 2ª Edição é apenas uma versão refinada e melhor feita do 1º (isso está em debate, mas eu não estou aqui para discutir).
Se você já executou algum módulo 3.5 no Pathfinder, será bem parecido. Use a lógica quando as estatísticas não corresponderem completamente e você achar que funciona muito bem.
Resumindo: Sim, eles são compatíveis, assim como a 1ª edição para a 2ª. Apenas esteja preparado de antemão.