O dano por fogo de 2d6 ou 4d6 de arma em chamas é definitivamente um bônus, então seria adicionado a qualquer dano da arma. Veja
She deals an extra 2d6 points of fire damage.
( ênfase meu)
A verdadeira questão é se o chicote de fogo é ou não uma "arma". É certamente como uma arma, sendo segurada, fazendo jogadas de ataque para causar dano, sendo elegível para Arma. Focus et al. , e contando como um chicote para talentos. Mas arma em chamas não é uma façanha.
Em última análise, você terá que perguntar ao seu Mestre se o chicote de fogo conta como uma arma para arma . Eu diria que é absolutamente necessário e que certamente parece ser, mas a redação não aparece e diga , por isso vale a pena perguntar ao seu mestre.(Por favor, note também que o pirocineticista é uma classe extremamente fraca; você pode jogar um mesmo assim, mas você deve estar ciente do que você está se metendo).