Usar três aranhas deixa claro que cada um é o efeito de uma mágica.

Enquanto ele poderia ter usado a mesma aranha para todas as Maldições Imperdoáveis, usar três aranhas diferentes é uma boa maneira de deixar claro para os estudantes que os efeitos causados são apenas o resultado do feitiço apenas lançar sobre ele, não um efeito cumulativo de múltiplas magias. Sabemos que conjurar várias magias no mesmo objeto pode, às vezes, alterar o efeito que aconteceria se apenas uma fosse lançada. Por exemplo, quando Harry, Rony e Hermione tentaram desarmar Snape (apesar de terem sido lançados todos ao mesmo tempo, não um após o outro), ao invés de apenas desarmar ele, eles o derrubaram e causaram uma explosão - que são efeitos típicos de Expelliarmus.

“Expelliarmus!’ he yelled – except that his wasn’t the only voice that shouted. There was a blast that made the door rattle on its hinges; Snape was lifted off his feet and slammed into the wall, then slid down it to the floor, a trickle of blood oozing from under his hair. He had been knocked out.

Harry looked around. Both Ron and Hermione had tried to disarm Snape at exactly the same moment.”
_{^{- Harry Potter and the Prisoner of Azkaban, Chapter 19 (The Servant of Lord Voldemort)}}

Nós sabemos que a Maldição Cruciatus deixa suas vítimas com dor residual.

“And these words burst from Harry’s mouth; they echoed through the graveyard, and the dream state was lifted as suddenly as though cold water had been thrown over him – back rushed the aches that the Cruciatus Curse had left all over his body – back rushed the realisation of where he was, and what he was facing …”
_{^{- Harry Potter and the Goblet of Fire, Chapter 34 (Priori Incantatem)}}

Usar três aranhas diferentes deixa claro que os efeitos que os alunos estão presenciando são apenas o efeito do feitiço que acabou de ser lançado. Mesmo que "Moody" soubesse que não faria diferença se ele usasse a mesma aranha, os alunos não tinham experiência com os efeitos das Maldições Imperdoáveis, então isso era uma demonstração mais clara. Além disso, não teria sido particularmente difícil ou consumir recursos para obter mais duas aranhas, então não havia realmente nenhuma razão para não fazê-lo.