Infelizmente, como não há mais explicações sobre por que Qui-Gon chamou Maul e isso, só podemos adivinhar. Um palpite muito educado.
Precisamos levar em consideração que a luta durou meros momentos e que o universo de Star Wars contém MUITAS espécies diferentes (até duas de pernas). Com algumas das espécies parecendo muito semelhantes entre si e também algumas com 2 sexos, algumas 1 e algumas provavelmente mais de 2.
Como um Jedi, Qui-Gon viajou um pouco pela galáxia, mas provavelmente ainda não viu todas as espécies. Assim, a informação acima combinada com a brevidade da batalha, é muito provável que Qui-Gon não pudesse ter certeza de que espécie Maul vinha de ... e também que gênero ele tinha.
Assim, chamar Maul é o método mais neutro de falar sobre Maul (eu ouso dizer que até mesmo o jeito Jedi é desse jeito ... pois é a maneira mais correta de falar sobre Maul sem implicar algo que o Jedi não tinha certeza sobre).