Não é o mesmo cristal
Durante seu duelo com Luke , o sabre de luz de Vader caiu no abismo na Sala do Trono de Palpatine, no fundo da qual se encontra o "núcleo do reator" da Estrela da Morte II.
De acordo com o livro de conclusões Ultimate Star Wars :
In their final duel, Luke momentarily succumbs to his anger and cuts off his father's hand. Thus Vader's lightsaber falls into the same energy well in which Sidious perishes.
Pela Novelização Oficial :
The hand, along with bits of metal, wires, and electronic devices, clattered uselessly away while Vader’s lightsaber tumbled over the edge of the span, into the endless shaft below, without a trace.
De acordo com a nova Junior Novelisation :
But Luke slashes with his saber, slicing Vader’s arm off. The metal limb tumbles down into the shaft, taking the lightsaber with it.
Note que a Estrela da Morte II explodiu pouco depois com muito poucos sobreviventes. Todas as contas (tanto no cânone principal quanto na UE) têm o sabre sendo destruído quando ele cai no núcleo do reator.