Como você apontou, a saída de energia da estrela no centro do Olho da Harmonia é vasta, mas finita. E com Gallifrey (até onde ele sabia na época) morto e desaparecido, uma vez que o poder se foi, não há como conseguir outro. O médico tem sido capaz de usar energia rift de tempos em tempos para recarregar alguns dos sistemas de energia, mas não sabemos se eles estão ligados ao olho (pense em BTTF - o Sr. Fusion acionou os circuitos de tempo, mas o carro ainda precisava de gasolina para funcionar). Se for esse o caso, usar o poder do Olho para qualquer outra coisa que não seja viagem no tempo significa uma viagem a menos que o Médico consiga fazer.
Também vale a pena ressaltar que ele não estava usando o poder para abrir a fenda. A fenda estava em processo de fechamento, e ele estava usando o poder para impulsionar um sinal através do último pequeno orifício antes de se isolar completamente. Sendo esse o caso, drenando poder do olho pode ter sido um exagero.
Então, pode ter sido apenas o médico sendo conservador com um suprimento limitado de combustível. Por que queimar a energia do Olho quando desviar uma supernova funcionaria tão bem?