Eu não consigo me lembrar de nenhuma explicação sobre canon sobre o motivo pelo qual Yoda escolheu Dagobah, além de uma frase na "Revenge of the Sith" em que ele diz
YODA: Into exile I must go. Failed, I have.
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Scene 236 : EXT. DAGOBAH-DAY A small escape pod hurls toward the swamp planet and disappears in the mist. The pod has landed, and YODA descends the ramp, surveying the unfamiliar terrain.
Nos rascunhos mais antigos do ESB, Luke diz ao R2D2 que o sistema Dagobah não está em mapas de navegação, sugerindo que Lucas está sendo guiado pela força, em vez de qualquer conhecimento transmitido por Ben.
Luke : We're going to the Dagobah System.
(Artoo beeps)
Luke : We have enough power.
(Artoo sing-songs a bit of chatter)
Luke: They don't need us there.
(Artoo beeps)
I'm countermanding the order...I'm a commander, remember.
Luke checks his readouts and makes a few adjustments. He rides along with only the soft hum of the instruments to break the silence. Finally, Artoo chirps up.
LUKE : Yes, Artoo.
Artoo answers with a soft carefully-put phrase of whistles.
LUKE : Yes, Artoo, I know the Dagobah System doesn't appear on any of our navigational charts. But, don't worry, it's there.
(Artoo beeps a worried beep)
LUKE: I'm very sure .... trust me.
Essa troca foi strongmente editada em versões posteriores. Obviamente, Luke descobre que ele precisa falar com Yoda (em Dagobah) quando ele é abordado pelo fantasma de Obi Wan. Não há razão para supor que Dagobah foi intencionalmente purificado dos registros imperiais, simplesmente que é muito pouco importante ou obscuro para merecer uma menção.
Há uma extensa discussão sobre Dagobah na Trilogia Thrawn ( não-canon ) Timothy Zahn em que ele explica que a morte de um poderoso sith no planeta chamado Bpfassh , criou o "Dark Force Cave" que é o que protege Yoda dos poderes do Imperador.