É difícil provar uma negativa, especialmente em um país como a Indonésia, onde as companhias aéreas aparecem e desaparecem durante a noite, mas não , não acredito que haja voos diretos ou balsas.
Existem três aeroportos de qualquer tamanho em Flores: Komodo / Labuanbajo (LBJ), Ende (ENE) e Maumere (MOF), nenhum dos quais serve a maior cidade de Sulawesi e o aeroporto mais próximo geograficamente em Makassar (UPG). É, portanto, altamente improvável que existam serviços diretos, e você provavelmente é melhor desviar através do Denpasar-Bali (DPS) , que é bem conectado a todos os quatro e um monte de outros aeroportos em Sulawesi também:
(cortesia Great Circle Mapper )