Esta é uma variante de uma pergunta muito comum neste site. Se a companhia aérea lhe vendeu o bilhete como um itinerário, em um único PNR, eles estão informando que pretendem levá-lo ao seu destino final, independentemente do que aconteça.
Eu não estou familiarizado com o aeroporto de Guadalajara, mas não parece tão grande ou on-line. Como você está vindo de um destino doméstico e o México não tem instalações de pré-compensação para voos para os EUA, eu acho que 55 minutos teriam tempo de sobra em caso de operações normais. Se o seu primeiro voo estiver atrasado e você perder a sua conexão, o resultado depende muito de como você comprou o seu bilhete. Se comprado como um único bilhete (o que provavelmente parece ser a forma como você descreve a situação), você será remarcado no próximo voo para o seu destino. Se forem adquiridos separadamente, eles poderão voltar a registrá-lo como um gesto de boa vontade, mas (talvez mais provavelmente), você precisará comprar um novo ingresso para o próximo vôo.