Acho que as seções que você vinculou apresentam a resposta para sua pergunta:
Familiares: "Somente um animal normal e não modificado pode se tornar um familiar". Animal Companion: "A companheira de (...) druida é completamente típica para o seu tipo, exceto conforme descrito abaixo."
Um animal polimorfo não pode ser considerado nem "normal, não modificado" ou "típico para o seu tipo": é uma criatura temporariamente alterada. Embora a duração da magia seja permanente, o alvo retém algo de sua forma original e a magia pode ser revertida por outras magias ou efeitos mais poderosos, que juntos transformam o sujeito alterado em uma criatura anormal, modificada e atípica. do seu tipo.
Por outro lado, a idéia parece divertida, e você, como GM, está em condições de alterar as regras como quiser (contanto que isso não afaste seus jogadores, obviamente;)) - no entanto , se você introduzir algo assim, a resposta ao destino do sujeito depois de ser modificada também depende de você inventar.