(aviso habitual de que eu não sou um advogado profissional e que você deve consultar um)
Você tem razão em questionar o PRD como sendo 100% de conteúdo aberto, já que de fato existem alguns termos PI usados nele. A declaração de Conteúdo Aberto do PRD apenas especifica que as regras incluídas são abertas (em termos semelhantes a muitos produtos impressos que declaram a mesma coisa), em nenhum momento ele realmente declara que o texto completo do PRD é Conteúdo Aberto . Além disso, o PI se enquadra nos termos implícitos do OGL como sendo protegido na seção 1 (e) da Licença. Dessa forma, o PRD não pode ser considerado como 100% Open Content da mesma forma que o SRD do d20 pode.
Sua melhor opção é escolher esses termos e enviar um e-mail diretamente para a Paizo para saber se não há problema em usá-los no OGL.
Um exemplo notável é o "Pathfinder Chronicler" da Classe Prestige, que é um termo específico usado no contexto de Golarion de Paizo e não um nome genérico como "Loremaster", "Wizard" ou "Fighter", além de conter o termo "Pathfinder", que é protegido como PI, como o próprio nome do produto. Neste exemplo, você pode criar uma classe de prestígio em um produto OGL usando as regras do Pathfinder Chronicler (ou simplesmente reproduzir a própria classe), mas teria que chamá-la de algo diferente. Para emprestar um pouco da resposta de Mxyzplk, você provavelmente poderia chamá-lo de "Cronista PF";)
Note que o conselho que estou dando é baseado na interpretação da declaração OGC de Paizo, não na intenção. Pode ser que eles pretendam que todos os termos dentro do PRD sejam abertos, mas eles não disseram especificamente isso em sua declaração. Obter permissão / esclarecimento da Paizo é uma simples questão de enviar um e-mail, portanto, não há realmente nenhuma razão para não pedir que eles tenham 100% de certeza sobre o assunto. Assumindo que está tudo bem, porque outros produtos usaram esses termos (e eles têm) não é uma boa prática - isso apenas significa que você também estará em violação se os OGL estiverem.
Os e-mails de contato da Paizo podem ser encontrados no link - meu palpite é que o coordenador de licenciamento seria um bom lugar para começar a perguntar .