O site que você vincula diz:
In principle, you should have a legitimate long term residency in Thailand. [...] If you came to Thailand only as a tourist and plan to apply for a Japanese visa, please contact JVAC or the Embassy by phone.
Então a resposta é geralmente não , você não pode se inscrever na Tailândia a menos que você mora lá, você precisará voltar para casa. É claro que você pode tentar a sua sorte e ligar, mas a menos que haja boas circunstâncias (emergência da família, etc), duvido que eles permitam que você se candidate.
Meu entendimento também é que esta política geral se aplica a todas as embaixadas japonesas em todo o mundo.