Até onde sabemos, não há conexão direta entre os dois eventos.
Em "The Big Bang", alguma coisa forçou a TARDIS a um ponto específico no tempo - algo diretamente relevante para o casamento de Amy - e fez com que ela explodisse. Sabemos que o silêncio é supostamente culpado por isso, mas até o momento não temos ideia de como eles conseguiram. Essa explosão "realmente aconteceu", mas o The Doctor conseguiu reverter seus efeitos usando o próprio Pandorica. Em particular, as rachaduras no universo existiam antes da explosão (ondulando no tempo), mas fechando naturalmente depois.
Por outro lado, em "Viagem ao Centro da TARDIS", sabemos por que a TARDIS está em perigo de explodir: a equipe de salvamento de alguma forma danificou e comprometeu a segurança de seu sistema de contenção de combustível. Não há indicação de que o silêncio tenha algo a ver com isso. Não tem ligação aparente com Amy Pond, e não havia menção de rachaduras na parede. Além disso, o Doctor foi capaz de desfazer essa explosão "localmente" - causando um paradoxo que redefiniu o tempo em alguns dias, em vez de ter que reinicializar todo o universo.
A possibilidade da explosão da TARDIS é um "perigo" bastante genérico. Não parece haver qualquer razão para esperar que todos esses incidentes sejam conectados uns aos outros.