Os vencedores escrevem os livros de história. É tão simples assim.
Pela lógica do show, a mitologia egípcia (e realmente, sua civilização) foi criada em torno dos Goa'uld como deuses e mestres. Então, qualquer Goa'uld que os antigos egípcios estivessem realmente expostos seria o mais proeminente. Sokar e Cronus são os principais exemplos de Goa'uld que não se encaixam no tema mitologia egípcia - mas o primeiro foi banido e derrubado, e Cronus foi apenas semi-proeminente no show e só então em épocas posteriores, o que implica que Ra e os outros estavam subindo e Cronus estava saindo durante seu tempo na Terra.
Cronus também se tornou parte da mitologia grega, e vale a pena notar que a civilização grega realmente não começou até milhares de anos depois do egípcio. Mesmo assim, Cronus era um terror distante, um dos Titãs derrotados, e não uma das figuras no panteão grego. Pode-se teorizar que Cronus realmente tentou construir sua própria coisa do outro lado do mar a partir dos "deuses" egípcios, mas se viu isolado em seu lugar. Portanto, não é que os deuses egípcios são as posições de topo, mas sim que os principais Goa'uld se tornaram os deuses egípcios, e ficaram em posições aproximadamente semelhantes de força relativa, mesmo após a Terra se revoltar e se perder para eles.