Em primeiro lugar, você não pode "eliminar a parte 'magenética' da luz". Não é assim que a física funciona. Você pode perguntar no Physics.SE para maiores detalhes. Tendo dito isso, a luz é um fenômeno eletromagnético, e como tal pode ser manipulado por Magneto de acordo com o cânon:
He can also generate electromagnetic pulses of great strength and generate and manipulate electromagnetic energy down to photons. He can turn invisible by warping visible light around his body.[93] - via Wikipedia, with ukltimate source Vision and the Scarlet Witch #4 (February 1983)