Se você está falando sobre ferramentas como esta , você pode usá-los verticalmente.
O manual da ferramenta a que me vinculei não tem nenhuma menção às palavras horizontal , vertical , nível , plano ou vertical , por isso, se não o fizerem não te avise, você pode supor que está tudo bem.
Uma coisa a notar é que para lixar uma superfície vertical, você terá que segurar a ferramenta com mais força do que se estivesse trabalhando em uma superfície horizontal. Isso fará com que mais vibrações sejam transferidas para suas mãos e pulsos, o que os deixará mais cansados. Se você estiver fazendo uma grande área, isso pode causar lesões por esforço repetitivo; quando lixei algumas esquadrias de janelas um tempo atrás, demorou alguns dias para que meu pulso parasse de novo.