Looking at the lore of the manga, movies, TV series, video games of Pokemon, is it unreasonable to assume that an uncaptured Pokemon would always be hostile....
Não há correlação entre um Pokémon capturado e hostilidade, pois há exemplos mostrados onde o Pokémon capturado NÃO iria ouvir o seu mestre.
Exemplos:
No primeiro Pokémon, Charizard não escutou Ash no início, apesar de Charmander ter sido salvo por Ash e ser um bom "amigo".
Também no Pokemon Original, o Garados não quis ouvir "Team Rocket" e fazer o que quer.
Também há exemplos de Pokémons não capturados sendo amigáveis.
No Pokémon original, Pikachu nunca esteve dentro de uma pokebola, mas foi fiel a Ash durante toda a série.
Também no Pokémon original, Meowth, da "Equipe Rocket" nunca esteve dentro de uma pokebola, assim como Giovanni tendo uma forma persa sentada ao lado dele como um gato troféu.
... to a human, simply by the fact that they are human, even if they've never seen one before (an undiscovered island or something)?
Eu diria que ser humano não tem nada a ver com hostilidade, como no mundo real, alguns animais são hostis, outros não.
Also, would an uncaptured Pokemon actually be helpful to a human who's in some sort of a dire circumstance (for instance, someone who's about to fall to their death at the edge of a cliff, or someone who's lost without supplies and guiding them back to civilization)?
Houve casos de pokemon fazendo coisas boas. Eu acredito no pokemon original, o Squritle Squad acabou voltando para ajudar Ash, e então o líder se juntou a Ash por conta própria, e aceitou a vida dentro da pokebola.
A coisa sobre Ash, é que ele poderia ter tido a maioria de seus pokemons fora de Pokébolas, mas teria sido demais.Pikachu se recusou a entrar em uma pokeball embora.