Resistência Mágica dá vantagem em testes de resistência contra magias e outros efeitos mágicos - não impõe desvantagem contra os outros.
No seu caso, o PC está conjurando Dispel Magic e rolaria sua habilidade como normal.
No entanto, ainda é uma habilidade de checagem de DC19 contra o lançamento de feitiços - o que não é tarefa fácil. A maioria das classes não obtém proficiência adicionada a isso (apenas seu modificador de habilidade de conjuração). Um bardo com Jack-of-all-trades é uma exceção.