J. Jonah Jameson não desgostar do Homem-Aranha porque ele tem poderes. Ele não gosta dele porque ele usa uma máscara (entre outras razões).
J.J.J. foi de fato muito grande em direitos civis. "Por décadas, Jameson usou seu jornal como uma cruzada em apoio aos direitos civis de grupos minoritários" (de sua página da Marvel Wiki). Ele também usou seu jornal para cruzar a KKK.
Ele não era anti-mutante e adotou uma postura agressiva contra o candidato presidencial Graydon Creed por causa da política anti-mutante de Creed.
Então, não, Jameson nunca usaria o termo "Mutante" negativamente.