Deve ir com eles (criaturas convocadas com equipamentos, como anjos poderosos, demônios e demônios vêm com seus equipamentos e não deixam cair quando saem, afinal), mas lembre-se de que você compartilha caça-níqueis de itens com seu eidolon - você não pode ganhar os benefícios dos amuletos mágicos, por exemplo, ao mesmo tempo.
Referência para slots de itens compartilhados, PFSRD :
In addition, magic items interfere with the summoner’s connection to his eidolon. As a result, the summoner and his eidolon share magic item slots.
Isso também deve estar no Advanced Player's Guide, na descrição da classe do Summoner (especificamente, na seção que descreve como o Eidolons funciona no final).