Sim, desde que eles possam ver o alvo (de acordo com as Regras como Pretendido)

There are spells that create exceptions to this rule about needing a path clear of obstruction. One cantrip [that breaks] this rule is sacred flame. Sacred flame is one of the low level spells that has this text: "The target gains no benefit from cover for this saving throw." [...] So, they're getting no benefit from cover [...] and that includes total cover. So sacred flame is one of the few spells that allows you to target somebody even if they're behind total cover. [...] You can be looking through the window in the tower and cast it on someone outside.

Então, mecanicamente, isso significa que, contanto que o conjurador possa ver o alvo, ele pode atingi-lo, independentemente da quantidade de cobertura que ele tenha. Como a cobertura total é um tipo de cobertura, ela também é ignorada pela chama sagrada .

Para comparação, as regras normais para a mira determinam que se um conjurador estiver atrás de uma folha de vidro sem nenhuma linha de efeito possível para o alvo, eles não poderão alvejá-los com uma mágica.

Explicação narrativa

Jeremy Crawford continuou a partir do acima fornece algum raciocínio por trás do feitiço e por que ele foi escrito como é. Embora não seja vital para uma compreensão mecânica da magia (a lógica acima deve ser mais que suficiente), é interessante mesmo assim.

The narrative reason for that, the reason I wrote it that way, is that sacred flame is coming down from above the person. The idea is the cleric is calling this divine energy down on the target and it is not actually shooting out from the cleric, it's coming down. [Which is an exception] and in the game the exceptional always beats the general.

RAW: Cobertura total para chama sagrada

Chama sagrada faz não afirmar que ignora a cobertura, só que:

The target gains no benefit from cover for this saving throw. (PHB 272)

e, portanto, não anula a regra geral de que:

To target something, you must have a clear path to it, so it can't be behind total cover (PHB 204)

Se você não puder mirar em alguém, ele não precisará fazer um teste de resistência e, portanto, se ele receber um bônus ou não, isso é irrelevante. De acordo com isso, a cobertura total não oferece qualquer bônus para testes de resistência, em contraste com outros níveis de cobertura:

A target with half cover has a +2 bonus to AC and Dexterity saving throws.

A target with three-quarters cover has a +5 bonus to AC and Dexterity saving throws.

A target with total cover can't be targeted directly by an attack or a spell, .. (PHB 196)

Esse recurso é basicamente a versão de destino único de "espalhados pelos cantos".

Pergunta da RAI

Em este podcast Jeremy Crawford afirmou que chama sagrada ignora a cobertura (por exemplo, pode ser direcionada através de vidraças). Ele é um porta-voz oficial e sua declaração pode refletir o que os designers originalmente pretendem, mesmo que não seja o que aparece no livro. Como sempre, o Mestre pode tomar uma decisão sobre esse assunto da maneira que quiser, mas até hoje essa interpretação alternativa não apareceu em nenhuma errata escrita.