Não deve haver problemas. Cada passageiro recebe um cartão de embarque pessoal e pode pegar o voo. E também o preço do seu bilhete será maior do que o desconto para o segundo passageiro, para que a companhia aérea não perca dinheiro.
O site da WizzAir afirma:
The Wizz Discount Club fares are applicable to the accompanying passengers only in case the Club member is a traveller in the booking
Pelo que entendi, você faz parte da reserva. Não é necessário embarcar no voo para usar o desconto para o outro passageiro da reserva.